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会下设四个工作机构、三个专业委员会和二个代表处。 工作机构 秘书处： 综合协调处理协会日常事务工作，负责协会的人事财务，负责与各办事机构、分支（代表）机构和会员单位的联络，承担领导交办的各项事务工作。 培训部： 综合管理协调协会的培训工作，开展业务咨询和会展服务工作，编辑培训大纲、教材和参考资料等。 学术部： 开展医药学术交流、考察和科学研究，书刊、教材编辑。承担协会专家委员会的日常工作。 国际合作部 ：综合管理协调协会的国际交流与合作项目。开展国际间的交流与合作，采取“走出去，引进来”的方式，促进国际间同行的学习与交流.分支机构。高等药学院校（系）委员会 参与全国高等药学教育的规划、计划及有关方针、政策的研究和讨论，为有关部门的决策提供参考依据和建设性意见。承接上级领导部门委托的有关药学事业研究课题或其他任务。定期召开各种研讨会，促进国际与校际的协作与交流。举办各种进修班、学术报告会、组织业务培训、编写有关教材以及咨询服务工作。 成人教育委员会： 开展成人教育的理论研究，编辑和发行有关刊物、资料、教材、书籍等；为全国医药企事业单位提供培训和咨询服务；举办研讨会，开展学术交流与合作。 技术教育委员会 开展职业教育的理论研究，定期召开各种研讨会；编写和创新理论课程教材和实训课程教材；参与医药行业特殊工种职业资格标准的制定、职业培训和资格鉴定工作；开展国内外学术交流与合作。

《药学教育》创刊于1985年， 是由国家教育部主管，中国药科大学、中国医药教育协会等单位联合主办的高等药学教育研究期刊，是药学教育界公开发行的社科类刊物。

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中国医药教育协会是经中华人民共和国民政部批准的国家一级协会，成立于1992年7月3日。是全国唯一的一个医药教育学术性社团组织，其主管部门是国务院国有资产监督管理委员会。其宗旨是：全面贯彻国家医药教育、药品监管、医药卫生工作方针和政策、法规，坚持以人为本的科学发展观，组织会员单位不断创新，共同发展医药教育事业，提高医药从业人员的素质，为实现医药现代化服务。 中国医药教育协会的业务范围是：医药教育管理、业务培训、学术交流、专业展览、书刊编辑、咨询服务、国际合作。协会涉及的主要工作领域是：高等药学教育、医药职业技术教育、药监系统和医药行业的岗位培训、医药行业继续教育、国际合作等。协会建立了全国医药教育网站，与中国药科大学，广东药学院共同主办“药学教育”杂志，并创办了“医药教育通讯”。 中国医药教育协会下设三个专业委员会和协会秘书处、培训部、学术部、国际合作部等常设工作机构。 中国医药教育协会自成立以来，根据协会的章程，在主管部门的指导下，积极开展工作，建立了具有特色的全国医药教育网络。成立了高等药学院校（系）委员会、职业技术教育委员会、成人教育委员会,这三个委员会的建成，构成了协会工作的主体，包括了高等药学教育、医药职业技术教育、医药行业职工的岗位培训和继续教育在内的医药教育部门的各个层次和专业领域。在教育层次上涉及培养从中专生到博士生的多层次各类药学专门人才，涉及培养在职的初级到高级的专业技术人员、行业管理干部，覆盖了医药教育的方方面面。 近年来，中国医药教育协会在国务院国有资产监督管理委员会的领导下，全面贯彻党的路线方针、政策，坚持科学发展观，围绕中心、服务大局，开展了一系列活动。与清华大学、北京大学、人民大学等知名大学举办了研究生课程及学位班；与卫生部人才交流服务中心举办了“全国医药卫生行业第六届人才交流洽谈会；开展了 “放心用药教育工程”诚信品牌活动；举办了肝病用药、乳腺疾病、健康饮奶、皮肤顽症等科普宣传教育活动。为庆祝抗战胜利六十周年，在人民大会堂举办了新骨态心系革命老区，药品捐赠启动仪式，会后我们分赴井岗山、安徽经县、陕西商州、米脂，为抗日老战士捐赠药品价值200多万元。我们创建了协会网站——中国医药教育协会网；建立了医药搜索引擎，目前已输入上万个品种；拟同美国马里考帕大学联合在网上举办健康教育大课堂等。协会以安全用药教育为宗旨，发挥自身资源优势，组织会员单位，心系大众、关爱民众健康，开展了一系列活动，取得了良好的社会效益。 目前，医药教育形势大好，提高教育质量，培养创新型人才是高等教育一项突出任务，加强职业技术教育、提高企业自主培训能力、搞好技能人才队伍建设是当前的热点问题。我们要抓住机遇，乘势而上，发挥协会的组织协调作用，努力争取政府部门的支持，加强对各委员会的指导，为推动我国医药教育事业的创新和发展做出更大贡献。组织机构 协会下设四个工作机构、三个专业委员会和二个代表处。 工作机构 1、秘书处： 综合协调处理协会日常事务工作，负责协会的人事财务，负责与各办事机构、分支（代表）机构和会员单位的联络，承担领导交办的各项事务工作。 2、培训部： 综合管理协调协会的培训工作，开展业务咨询和会展服务工作，编辑培训大纲、教材和参考资料等。 3、学术部： 开展医药学术交流、考察和科学研究，书刊、教材编辑。承担协会专家委员会的日常工作。 4、国际合作部 综合管理协调协会的国际交流与合作项目。开展国际间的交流与合作，采取“走出去，引进来”的方式，促进国际间同行的学习与交流.分支机构 1、高等药学院校（系）委员会 参与全国高等药学教育的规划、计划及有关方针、政策的研究和讨论，为有关部门的决策提供参考依据和建设性意见。承接上级领导部门委托的有关药学事业研究课题或其他任务。定期召开各种研讨会，促进国际与校际的协作与交流。举办各种进修班、学术报告会、组织业务培训、编写有关教材以及咨询服务工作。 2、成人教育委员会： 开展成人教育的理论研究，编辑和发行有关刊物、资料、教材、书籍等；为全国医药企事业单位提供培训和咨询服务；举办研讨会，开展学术交流与合作。 3、职业技术教育委员会 开展职业教育的理论研究，定期召开各种研讨会；编写和创新理论课程教材和实训课程教材；参与医药行业特殊工种职业资格标准的制定、职业培训和资格鉴定工作；开展国内外学术交流与合作。